Шпаргалка по "Биохимии"

Вторым  компонентом  нуклеотидов являются углеводы     

Углеводным компонентом  РНК является  D-рибоза, а ДНК -   D-2-дезоксирибоза. В составе НК углеводные компоненты находятся в β-D- фуранозной форме:

Небольшое отличие- отсутствие ОН-группы у С-2҆’ дезоксирибозы  является  одной из причин различий в св-х ДНК и РНК.

Отсутствие ОН-группы у С-2҆’ дезоксирибозы 1)делает прочнее связь между 2 и 3 атомом С в сахаре (консервативность как хранителя наследственности), 2)молекула ДНК может компактно складываться.

Наличие ОН- группы  у рибозы обеспечивает способность к щелочному гидролизу

НК осуществляют такие  ф-и как хранение и передача генетической информ., с участием НК происходит  биосинтез белков, Мономерные  звенья НК- нуклеотиды играют самостоятельную важную роль в метаболизме.

В отличие от ДНК, молекулы РНК состоят из одной полинуклеотидной цепи и не имеют строго определенной пространственной формы (вторичная  структура РНК зависит от их биол. фун-й). Осн. роль РНК – непосредственное участие в биосинтезе белка.

32 Энергия активации, механизм действия  ферментов для односубстратной реакции.

Для протекания любой реакции  необходимо, чтобы реагирующие молекулы пришли в контакт друг с другом. Реакция протекает только в том  случае, если молекулы обладают достаточным  запасом кинетической энергии. Совокупность молекул любого в-ва представляет собой статический набор молекул с различной кинетической энергией. Количество энергии (выраженное в калориях), которое необходимо для перевода при данной температуре всех молекул одного моля вещества в активированное состояние, называется  энергией активации.

Доказано, что в ходе ферментативного  катализа происходит образование промежуточного соединения – комплекса фермента с его субстратом. Это приводит к появлению нового переходного  состояния, которое характеризуется  меньшей свободной энергией активации, по сравнению с переходным состоянием некатализируемой реакции.  Катализаторы ускоряют химическую реакцию, понижая свободную энергию активации. Благодаря тому, что биолог. катализаторы снижают энергию активации, фермент. реакции протекают с высокой скоростью при относительно низкой температуре. Преодоление энергии акт-и в хим.реакции достигается либо увеличением энергии взаимод-щих молекул, напр-р нагреванием, облучением, повышением давления, либо снижением требуемых для реакции затрат энергии при помощи катализаторов.

Ферментативные реакции  по числу участников делятся на односубстратные и двухсубстратные.

Односубстратные ( изомеризация- односубстратная однопродуктная реакция, Мономолекулярные реакции (А→Р)). Гидролитические реакции можно рассматривать как односубстратные, так как концентрацию 2 субстрата (вода) можно считать постоянной.  большинство из мономолекулярных реакций относятся к реакциям 1 порядка, поскольку скорость реакции пропорциональна концентрации только 1го  реагирующего вещества.(V=k1[S]). Порядок реакции определяется характером ее зависимости от концентрации субстрата.  

Простейшая  односубстратная реакция описывается обычно схемой Михаэлиса-Ментен.

E + S→ ES→ P + E, где Е - фермент, S - субстрат, ES - промежуточный комплекс фермента с субстратом (комплекс Михаэлиса-Ментен), Р - продукт.

 

 

33 Механизм действия ферментов  для двухсубстратной реакции.

Ферментативные  реакции по числу участников делятся  на односубстратные и двухсубстратные.

Самый распространенный тип  фермент.реакции - двухсубстратная с образованием 2 продуктов: A+B↔C+D. (60% всех реакций, напр-р реакции переноса групп).

В зависимости от последовательности присоединения субстратов в двухсубстратных реакциях (A+B↔ C+D) различают 2 основных механизма этих реакций.

1.механизм  двойного замещения («пинг-понг  механизм»)

EA- фермент субстратный комплекс; С- первый продукт реакции; F- несколько измененная форма фермента; В- второй субстрат; FВ - фермент-субстратный комплекс;D-второй продукт реакции;

По такому механизму протекают, например, реакции  переаминирования.

2.последовательный  механизм, при котором оба субстрата  должны соединиться  с ферментом  и сформировать тройной комплекс. Прежде чем образуется 1 из продуктов.2 вида послед-го механизма: упорядоченный, неупорядоченный.

1. упорядоченный (по нему функционируют, например, НАД(Ф)⁺= зависимые дегидрогеназы, по этому механизму работают некот-е трансферазы и кретинкиназа)

2 неупорядоченный

 

Фермент содержит в активном центре 2  независимых участка  связывания субстратов, и их присоединение  к ферменту может происходить  в любой последовательности. Нет  и определенного порядка выхода продуктов реакции из активного  центра.